加速种子发芽的核心方法是利用肥料催熟系统。肥料由臭臭、灰烬块和骨头合成，需通过玻璃瓶制作。臭臭通过坐在马桶上获得，前提是食用增益食物后触发效果。灰烬块由燃烧木材或草木生成，骨头则通过击败敌怪或地下探索获取。制作完成后，将肥料使用在目标树苗上可立即催熟，显著缩短生长周期。此方法适用于各类植物种子，但需注意不同植物对肥料吸收效率可能存在差异。
植物生长环境对发芽速度有直接影响。树木类种子需种植在草块、腐化草块、丛林草块等特定方块上，且要求水平放置，左右保留至少一格空闲空间。垂直空间需满足最低高度，普通树木需16格，丛林树木需24格。若种植区域存在火炬、平台或其他障碍物，会阻碍生长。仙人掌类植物需种植在沙块上，且要求两侧至少一格空闲，同时需避免半砖阻挡。蘑菇树需5格宽的平地空间，上方16格内无背景墙。
草药类植物的生长阶段分为发芽期、成熟期和开花期。在发芽期收割无法获得任何产物，成熟期可收获草药但无种子，开花期同时掉落草药和种子。利用再生法杖可提升收割效率，额外增加种子掉落概率。死亡草等特定植物需在血月或满月开花时收割才能获取种子。飞镖机关可实现自动化收割，但需注意工具挥舞范围可能误伤未开花植株。手持种子时自动挥舞可精准识别开花状态，实现快速替换种植。
种子间距是影响群体生长效率的关键因素。树木类种子需保持至少三格水平间距，过密会导致生长停滞。两棵树苗可共用相邻空闲格，但需确保中间无遮挡。草药在黏土盆或种植盆中可避免意外破坏，但仅能通过镐子或再生法杖收割。种植盆支持悬空放置，适合搭建多层培育架。火把等光源虽不直接加速生长，但能改善培育区域视野，便于集中管理高价值植物。
最后需注意，部分特殊种子如南瓜需种植在普通草地，而水迹花需沙块环境且被水淹没才能开花。圣水可加速南瓜种子成熟，但需从商店购买。黏土盆和种植盆对草药无地形限制，但无法用于树木催熟。肥料系统虽高效，但材料收集过程可能消耗较多时间，建议提前储备基础资源。
