要解锁口袋妖怪火红中的岛屿区域，关键在于完成主线剧情并获取特殊道具。首先需要击败全部8个道馆馆主，集齐徽章后挑战并战胜精英四天王及冠军，这是进入后续岛屿的基本前提。之后的关键道具是彩虹通行证，该道具通常需要在二周目剧情中通过特定任务获取，比如在一号岛的网络中心协助NPC寻找红蓝宝石。获得彩虹通行证后，才能乘坐船只前往各个岛屿进行探索。
第八岛（海洋之心礁）和第九岛（训练家乐园）作为特殊区域，需要额外条件才能解锁。第八岛需要神秘船票，该道具在正常游戏流程中无法获得，历史上通过官方活动分发，现在通常需要通过特殊方式获取。持有船票后可从富士老人的家乘坐孤岛快船前往，岛上栖息着传说宝可梦路基亚和盖欧卡。第九岛则需要训练家乐园船票，同样需要通过特殊渠道获得，从绿宝石市集的港口出发即可抵达，岛上设有多种对战挑战模式。
双子岛作为新增区域，解锁方式与主线进度密切相关。在获得彩虹通行证后，需前往港口城市与船长对话出示该证件，才能乘船抵达。岛上设有特殊洞穴和任务，其中包含珍稀宝可梦的栖息地。双子岛的探索往往需要结合冲浪、攀瀑等秘传技能，因此在前往前需确保队伍已掌握必要技能。该区域的谜题设计通常涉及推石头等机关操作，需要合理规划行进路线。
七岛区域的解锁同样依赖剧情推进，在完成特定道馆挑战后会触发相关剧情。例如在获得第七枚徽章后，馆主会主动邀请玩家前往岛屿，可在一号岛实验室获得三岛通行证。各岛屿之间通过船只连接，部分岛屿设有独立任务链，如帮助寻找失踪女孩或对抗火箭队残党。这些任务往往能获得月之石等进化道具，同时也是推进区域解锁的关键环节。
游戏后期区域的进入往往需要结合多种条件，包括但不限于道具收集、剧情推进和技能掌握。建议在探索过程中注意与每个NPC对话，他们可能提供重要的区域解锁线索。部分隐藏区域如变化洞穴需要完成特定事件才会开放，而像训练师塔这样的挑战场地则要求玩家具备较高等级的队伍配置。整个岛屿系统的解锁过程体现了游戏层层递进的设计逻辑，需要玩家保持耐心逐步探索。
